|
Hafta
|
Konular
|
Ön Hazırlık
|
|
1
|
Orman patojenlerinin tespit, tanı ve genetik çeşitliliğinin belirlenmesinde moleküler yöntemler; gerekliliği, avantajları
|
K1, giriş
|
|
2
|
DNA, DNA extraksiyonu, DNA dizileme yöntemleri ve ve analizi
|
K1, B1
YK1, Part 2
|
|
3
|
Bitki patojenlerinin tespiti ve tanısında moleküler yöntemler-1
|
K1, B2,
YK1, Part 3, bölüm7, 10, 11
|
|
4
|
Bitki patojenlerinin tespiti ve tanısında moleküler yöntemler-1
|
K1, B2
YK1, Part 3, bölüm7, 10, 11
|
|
5
|
DNA izolasyonu; Fungal kültürlerden ve doğrudan çevresel örneklerden
|
Oskay, F., 2009. Orman Patolojisinde Moleküler Yöntemlerin Kullanımı. SDÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Orman Mühendisliği Anabilim Dalı, Doktora Semineri, Isparta, 47pp.
|
|
6
|
Toprak, odun ya da ibre gibi örneklerde patojen (lerin) tespiti ve tanısı
|
Gonthier, P., Guglielmo, F., Sillo, F., Giordano, L., & Garbelotto, M. (2015). A molecular diagnostic assay for the detection and identification of wood decay fungi of conifers. Forest Pathology, 45(2), 89-101.
Tunali, Z., & Doğmuş-Lehtijärvi, H. T. Oskay, F., Tunali, Z., & Doğmuş-Lehtijärvi, H. T. (2018). Burdur ili kızılçam (Pinus brutia Ten.) ormanlarında ibre yanıklığı ve dökümüne neden olan fungal etmenlerin moleküler yöntemlerle tespiti. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 22(2), 628-636.
|
|
7
|
DNA dizi analizi teori ve uygulaması (Tür teşhisi; DNA veri tabanı taraması (BLAST kullanımı))
|
Oskay, F., 2009. Orman Patolojisinde Moleküler Yöntemlerin Kullanımı. SDÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Orman Mühendisliği Anabilim Dalı, Doktora Semineri, Isparta, 47pp.
|
|
8
|
DNA dizi analizi ( Filogenetik tahmin )
|
Oskay, F., 2009. Orman Patolojisinde Moleküler Yöntemlerin Kullanımı. SDÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Orman Mühendisliği Anabilim Dalı, Doktora Semineri, Isparta, 47pp.
|
|
9
|
PCR`a dayalı DNA polimorfizim analizleri I (RFLP; RAPD; AFLP; RAMs; SSR; ISSR; SNPs; SSCP, vd.)
|
Oskay, F., 2009. Orman Patolojisinde Moleküler Yöntemlerin Kullanımı. SDÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Orman Mühendisliği Anabilim Dalı, Doktora Semineri, Isparta, 47pp.
|
|
10
|
PCR`a dayalı DNA polimorfizim analizleri II
|
Oskay, F., 2009. Orman Patolojisinde Moleküler Yöntemlerin Kullanımı. SDÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Orman Mühendisliği Anabilim Dalı, Doktora Semineri, Isparta, 47pp.
|
|
11
|
PCR`a dayalı DNA polimorfizim analizleri; orman patolojisi alanında kullanımları
|
Hantula, J., Dusabenyagasani, M., & Hamelin, R. C. (1996). Random amplified microsatellites (RAMS)?a novel method for characterizing genetic variation within fungi. European Journal of Forest Pathology, 26(3), 159-166.
|
|
12
|
Bitki hastalık etmenlerinin genetik çeşitliliğinin belirlenmesinde moleküler yöntemler; kullanım amaçları ve orman hastalıkları araştırmalarında sağladığı avantajlar
|
Stewart, J. E., Kim, M. S., & Klopfenstein, N. B. (2018). Molecular genetic approaches toward understanding forest-associated fungi and their interactive roles within forest ecosystems. Current forestry reports, 4(2), 72-84.
|
|
13
|
Bitki hastalık etmenlerinin genetik çeşitliliğinin belirlenmesinde moleküler yöntemler; kullanılan moleküler markörler, güncel araştırmalar
|
Genetic diversity of Dothistroma septosporum and diplodia sapinea in Turkey (Oskay et al 2020)
|
|
14
|
Orman patolojisinde moleküler yöntemlerin geleceği
|
Hamelin, R. C., & Roe, A. D. (2020). Genomic biosurveillance of forest invasive alien enemies: A story written in code. Evolutionary Applications, 13(1), 95-115.
Tedersoo, L., Drenkhan, R., Anslan, S., Morales‐Rodriguez, C., & Cleary, M. (2019). High‐throughput identification and diagnostics of pathogens and pests: overview and practical recommendations. Molecular ecology resources, 19(1), 47-76.
|